W Zakładzie Geologii i Paleogeografii prowadzone są m.in. badania w zakresie:
Ewolucji organizmów i paleoekologii w jurze
Skamieniałości Jury Częstochowskiej
Ewolucji życia na Ziemi
Paleoekologii, szczególnie z zakresu pasożytnictwa i patologii
Biomechaniki szkieletu bezkręgowców i mechaniki jego uszkodzeń w procesie diagenezy
Fauny i paleogeografii oligocenu Pomorza Zachodniego i obszarów przyległych
Archeocjatów